Paket: tabix (1.11-4)

[ Quellcode: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm, Wissenschaft: science::calculation, use::calculating, Unterstützt Formate: HTML, Hypertext Markup Language (Hypertext-Auszeichnungssprache), Arbeitet mit: Text

Andere Pakete mit Bezug zu tabix

• dep: libbz2-1.0

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.15) [nicht arm64, ppc64el]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  Schnelle DEFLATE-basierte Komprimierung und Dekomprimierung im gesamten Puffer

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	330,7 kB	1.087,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	308,5 kB	1.011,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	293,1 kB	1.004,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	298,7 kB	728,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	360,7 kB	1.200,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	312,8 kB	1.240,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	327,7 kB	1.215,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	358,6 kB	1.467,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	301,7 kB	1.151,0 kB	[Liste der Dateien]