Paket: gromacs-mpich (2020.6-2)

[ Quellcode: gromacs  ]

Molecular dynamics sim, binaries for MPICH parallelization

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains only the core simulation engine with parallel support using the MPICH (v3) interface. It is suitable for nodes of a processing cluster, or for multiprocessor machines.

Markierungen: Software-Entwicklung: C-Entwicklung, Bibliotheken, Feld: Biologie, field::chemistry, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::devel-lib, role::program, Zweck: Hilfswerkzeug, Arbeitet mit: Paketierte Software

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs-mpich

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  Bibliothek zur Berechnung Schneller Fourier-Transformationen (doppelte Genauigkeit)

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  Bibliothek zur Berechnung Schneller Fourier-Transformationen (einfache Genauigkeit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhwloc15 (>= 2.4.1+dfsg)

  Hierarchische Ansicht des Rechners - Laufzeitbibliotheken

• dep: libmpich12 (>= 3.4.1) [nicht amd64]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 3.4.1-3) [amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 10.2) [armel]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [amd64, i386, ppc64el]

  dep: libstdc++6 (>= 6) [nicht amd64, armel, i386, ppc64el]

• dep: mpich

  Implementation of the MPI Message Passing Interface standard

• dep: neon-support [armhf]

  prevent installation on processors without required instructions

• dep: sse2-support [i386]

  prevent installation on processors without required instructions

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: gromacs

  Simulator für Moleküldynamik, Werkzeuge für das Erstellen der Modelle und deren Analyse

• sug: gromacs-data

  Daten und Dokumentation für GROMACS, einen Simulator für Moleküldynamik

gromacs-mpich herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	6.701,7 kB	18.083,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	5.289,5 kB	14.433,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	3.426,3 kB	11.919,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	3.221,0 kB	8.727,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	5.967,2 kB	18.363,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	3.768,5 kB	14.581,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	3.908,2 kB	14.117,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	4.390,0 kB	14.645,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	3.277,8 kB	13.055,0 kB	[Liste der Dateien]