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Paket: gromacs (2020.6-2)

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Simulator für Moleküldynamik, Werkzeuge für das Erstellen der Modelle und deren Analyse

GROMACS ist ein vielseitiges Paket, um Molekulardynamik anzuwenden, z.B. um die Newtonschen Bewegungsgleichungen für Systeme mit Hunderten bis zu Millionen von Teilchen zu simulieren.

Es wurde primär für biochemische Moleküle wie Proteine und Fette entworfen, die eine Vielzahl von komplizierten Wechselwirkungen zwischen Bindungen aufweisen. Da aber GROMACS die zwischenmolekularen Interaktionen (welche in Simulationen dominieren) extrem schnell berechnen kann, nutzen es viele Gruppen auch für Forschungen an nicht-biologischen Systemen, z.B. an Polymeren.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, field::chemistry, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, interface::graphical, interface::x11, Rolle: Programm, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X-Window-System: Anwendung

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