Paket: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2)

[ Quellcode: amap-align  ]

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::analysing, use::comparing, Unterstützt Formate: Reiner Text, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nicht armel, armhf, s390x]

amap-align herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	129,2 kB	1.214,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	121,6 kB	1.182,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	106,8 kB	1.174,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	107,2 kB	1.118,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	112,0 kB	1.186,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	128,3 kB	1.216,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	127,3 kB	1.218,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	140,3 kB	1.230,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	109,2 kB	1.202,0 kB	[Liste der Dateien]