Alle Optionen
[  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Quellcode: pairtools  ]

Paket: python3-pairtools-examples (0.3.0-2 und andere)

Links für python3-pairtools-examples

Screenshot

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket pairtools herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Andere Pakete mit Bezug zu python3-pairtools-examples

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • erweitert

python3-pairtools-examples herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
arm64 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
armel 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
i386 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
mipsel 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 0.3.0-2+b2 11,8 kB50,0 kB [Liste der Dateien]