Paket: probalign (1.4-10)

[ Quellcode: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Andere Pakete mit Bezug zu probalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, ppc64el]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	68,9 kB	175,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	64,6 kB	219,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	55,1 kB	142,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	53,9 kB	114,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	61,4 kB	158,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	65,4 kB	223,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	64,2 kB	221,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	78,4 kB	219,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	56,7 kB	171,0 kB	[Liste der Dateien]