Paket: libnhgri-blastall-perl (0.66-4)

Links für libnhgri-blastall-perl

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket libnhgri-blastall-perl herunterladen:

Betreuer:

Debian Perl Group (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Jens Preussner (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [ftp.nhgri.nih.gov]

Perl extension for running and parsing NCBI's BLAST 2.x

NHGRI::Blastall will enable usage of BLAST out of a Perl script, if BLAST2 or WU-BLAST are installed locally. Main features are:

 * run BLAST (also via network, which requires blastcl3)
 * BLAST single sequences against each other or against a given library
 * format databases
 * mask out repetitive DNA
 * read, parse and filter existing BLAST reports

Markierungen: Software-Entwicklung: Perl-Entwicklung, Bibliotheken, Implementiert in: Perl

Andere Pakete mit Bezug zu libnhgri-blastall-perl

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

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