all options
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Source: zalign  ]

Package: zalign (0.9.1-2 and others)

Links for zalign

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package zalign:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Parallel lokal sammenligning af biologiske sekvenser

ZAlign er en lokal sekvenssammenligner, specielt lavet for brug med store biologiske DNA-sekvenser, med mere end 1 Mbp (millioner basispar). Den bruger Smith-Watermans præcise algoritme med affine gap cost-funktion til at udføre denne opgave.

ZAlign kan bruges både i distribuerede (for eksempel klynger) eller uafhængige miljøer. I øjeblikket er programmet blevet testet både på Linux og Sun Solaris, med brug af både MPICH- (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) og OpenMPI- implementeringer (http://www.open-mpi.org/). Oversættelser (ports) til andre Unix-lignende miljøer er under kraftig overvejelse.

Other Packages Related to zalign

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download zalign

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 0.9.1-2+b3 47.4 kB266.0 kB [list of files]
arm64 0.9.1-2+b3 45.0 kB266.0 kB [list of files]
armel 0.9.1-2+b3 26.1 kB118.0 kB [list of files]
armhf 0.9.1-2+b3 26.8 kB102.0 kB [list of files]
i386 0.9.1-2+b3 48.2 kB256.0 kB [list of files]
mips 0.9.1-2+b3 49.0 kB319.0 kB [list of files]
mips64el 0.9.1-2+b3 51.5 kB559.0 kB [list of files]
mipsel 0.9.1-2+b3 50.0 kB319.0 kB [list of files]
ppc64el 0.9.1-2+b3 48.4 kB418.0 kB [list of files]
s390x 0.9.1-2+b3 46.6 kB306.0 kB [list of files]