Source Package: snippy (4.6.0+dfsg-6)
Links for snippy
Debian Resources:
Maintainers:
External Resources:
The following binary packages are built from this source package:
- snippy
- Hurtig haploid-variantkald og kernegenomjustering
- snippy-examples
- Hurtig haploid-variantkald og kernegenomjustering - eksempler
Other Packages Related to snippy
-
- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Package not available
-
- adep:
any2fasta
- Konverter diverse sekvensformater til FASTA
-
- adep:
bcftools
- Genomisk variantkald og manipulering af VCF/BCF-filer
-
- adep:
bedtools
- Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner
-
- adep:
bwa
- Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
-
- adep:
freebayes
- Bayesian haplotype-baseret polymorfiregistrering og genotypebestemmelse
-
- adep:
libbio-perl-perl
- BioPerl - grundlæggende Perlmoduler
-
- adep:
libvcflib-tools
- C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer - værktøjer
-
- adep:
minimap2
- Alsidig parvis sammenligner for genomiske og opdelte nukleotide sekvenser
-
- adep:
parallel
- Byg og afvikl kommandolinjer fra standardind parallelt
-
- adep:
samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- adep:
samclip
- Filtrer SAM-fil for blødt og hårdt klippet sammenligninger
-
- adep:
seqtk
- Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ
-
- adep:
snp-sites
- Binær kode for pakken snp-sites
-
- adep:
snpeff
- Genetisk variantannotation og effektforudsigelsesværktøjskasse - værktøj
-
- adep:
vt
- Værktøjssæt for kort variant-registrering i genetiske sekvensdata
