Package: seqprep (1.3.2-9)
Links for seqprep
Debian Resources:
Download Source Package seqprep:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Tim Booth (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Nilesh Patra (QA Page)
External Resources:
- Homepage [seqanswers.com]
Similar packages:
Strippe adaptere og/eller sammenføjede parrede læsninger af DNA-sekvenser med overlap
SeqPrep er et program til at sammenlægge parrede Illuminalæsninger, der overlapper hinanden ind i en enkelt længere læsning. Det kan også bruges til sin adaptertilpasningsfunktion uden at udføre nogen parrede slut-overlapninger. Når en adaptersekvens er nuværende, det betyder, at de to læsninger skal overlappe (i de fleste tilfælde) så de er kraftigt fusioneret. Når læsninger ikke har adaptersekvens, skal de behandles omhyggeligt, når man laver sammenføjningen, så en langt mere specifik fremgangsmåde er valgt. Standardparametrene blev valgt med tanke på specificitet, så at de kunne køres på biblioteker, hvor meget få læsninger forventes at overlappe hinanden. Det er dog altid sikreste at gemme den overlappende procedure for biblioteker, hvor du har forudgående kendskab til, at en væsentlig del af læsningerne vil have overlapning.
Other Packages Related to seqprep
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
Download seqprep
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 26.7 kB | 167.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 27.5 kB | 99.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 26.2 kB | 103.0 kB | [list of files] |
| armel | 28.0 kB | 110.0 kB | [list of files] |
| armhf | 26.6 kB | 82.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 28.4 kB | 131.0 kB | [list of files] |
| i386 | 27.3 kB | 90.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 33.7 kB | 185.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 26.2 kB | 94.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 26.7 kB | 169.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 26.4 kB | 167.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 26.4 kB | 103.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 28.1 kB | 99.0 kB | [list of files] |
| s390x | 26.6 kB | 103.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 32.4 kB | 102.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 26.3 kB | 1,064.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 27.5 kB | 98.0 kB | [list of files] |