Package: libmems1 (1.6.0+4725-9 and others) [debports]

[ Source:  ]

Bibliotek til at understøtte DNA-strengmatchning og komparativ genomik

LibMems er er et frit tilgængeligt programudviklingsbibliotek, der understøtter DNA-strengmatchning og komparativ genometik. Blandt andet implementerer libMems en algoritme til at udføre omtrentlig fler-MUM- og fler-MEM-identifikation. Algoritmen bruger »spaced seed«-mønstre sammen med en hashingmetode i seed og udvid-stil for at identificere matchninger. Metoden er effektiv, kræver et maksimum på kun 16 byte per base af den største inddatasekvens og disse data kan lagres eksternet (f.eks. på en disk) for yderligere at reducere hukommelseskravet.

Denne pakke indeholder det dynamiske bibliotek.

Other Packages Related to libmems1

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filsystemhandlinger (flytbare stier, iteration over mappere etc.) i C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Bibliotek for Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgenome0 (>= 1.3.11+svn20110227.4616)

  Værktøjssæt til at udvikle bioinformatik-relaterede programmer

• dep: libmuscle1 (>= 3.7+4565)

  Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download libmems1

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
riscv64 (unofficial port)	1.6.0+4725-9+b1	703.6 kB	1,668.0 kB	[list of files]