Package: python3-freecontact (1.1-6 and others)

[ Source: python-freecontact  ]

Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Python 3

FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).

FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.

En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.

Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.

Denne pakke indeholder Python 3-bindingen.

Other Packages Related to python3-freecontact

• dep: libboost-python1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [riscv64, x32]

  biblioteket Boost.Python Library

• dep: libboost-python1.74.0-py311 [riscv64, x32]

  virtual package provided by libboost-python1.74.0

• dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [not riscv64, x32]

  biblioteket Boost.Python Library

• dep: libboost-python1.83.0-py311 [not riscv64, x32]

  virtual package provided by libboost-python1.83.0

• dep: libboost-python1.83.0-py312 [not riscv64, x32]

  virtual package provided by libboost-python1.83.0

• dep: libc6 (>= 2.32) [not alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.32) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libfreecontact0t64 (>= 1.0.21) [not riscv64, x32]

  Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek

• dep: libfreecontact0v5 (>= 1.0.21) [riscv64, x32]

  Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• dep: python3 (<< 3.12) [riscv64, x32]

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.13) [not riscv64, x32]

  dep: python3 (>= 3.11~)

Download python3-freecontact

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.1-6+b7	86.5 kB	410.0 kB	[list of files]
amd64	1.1-6+b7	90.7 kB	372.0 kB	[list of files]
arm64	1.1-6+b7	85.0 kB	406.0 kB	[list of files]
armel	1.1-6+b7	82.8 kB	344.0 kB	[list of files]
armhf	1.1-6+b7	84.8 kB	304.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.1-6+b7	89.3 kB	392.0 kB	[list of files]
i386	1.1-6+b7	93.2 kB	368.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.1-6+b7	95.0 kB	517.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.1-6+b7	89.0 kB	356.0 kB	[list of files]
mips64el	1.1-6+b7	84.1 kB	418.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.1-6+b7	88.5 kB	472.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.1-6+b7	88.7 kB	406.0 kB	[list of files]
riscv64 (unofficial port)	1.1-6+b4	70.1 kB	234.0 kB	[list of files]
s390x	1.1-6+b7	89.2 kB	366.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.1-6+b5	94.9 kB	406.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.1-6+b7	83.3 kB	2,204.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.1-6+b4	71.8 kB	243.0 kB	[list of files]