Package: python3-bx (0.11.0-4 and others)

[ Source: python-bx  ]

Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:

 * Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local-
   sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater)
 * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder
   datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for
   eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle
   sammenligninger i store filer; optimeret for brug over
   netværksfilsystemer
 * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser
 * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse,
   men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt
   eller alle ikke satte bit for kompakt lagring
 * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer
   både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation

Other Packages Related to python3-bx

• dep: libc6 (>= 2.11) [not alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.11) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.12) [x32]

  dep: python3 (<< 3.13) [not x32]

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-lzo

  Pythonbindinger for LZO-datakompressionsbiblioteket - Python 3

• dep: python3-numpy [x32]

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [not x32]

• dep: python3-numpy-abi9 [not x32]

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download python3-bx

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.11.0-4	969.6 kB	7,201.0 kB	[list of files]
amd64	0.11.0-4	1,044.2 kB	5,753.0 kB	[list of files]
arm64	0.11.0-4	930.3 kB	6,317.0 kB	[list of files]
armel	0.11.0-4	910.2 kB	5,125.0 kB	[list of files]
armhf	0.11.0-4	945.2 kB	4,125.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.11.0-4	997.6 kB	5,760.0 kB	[list of files]
i386	0.11.0-4	1,065.1 kB	5,977.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.11.0-4	1,140.4 kB	9,842.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.11.0-4	935.0 kB	5,167.0 kB	[list of files]
mips64el	0.11.0-4	866.4 kB	6,753.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.11.0-4	999.5 kB	8,239.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.11.0-4	1,013.4 kB	7,853.0 kB	[list of files]
riscv64	0.11.0-4	1,064.0 kB	4,843.0 kB	[list of files]
s390x	0.11.0-4	1,021.2 kB	5,941.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.11.0-4	1,147.7 kB	6,051.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.11.0-4	881.8 kB	46,649.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.10.0-1	1,904.9 kB	4,618.0 kB	[list of files]