all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source:  ]

Package: yaha (0.1.83-3) [debports]

Links for yaha

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Find split-read-oversættelser på single-end-forespørgsler

Yaha er en fleksibel, sensitiv og præcis DNA-sammenligner designet for single-end-læsninger. Programmet understøtter tre major-tilstande:

 * Standardtilstanden »Optimal Query Coverage« (-OQC) rapporterer
   det bedste sæt af sammenligninger som dækker længden af hver
   forespørgsel
 * Brug af »Filter By Similarity« (-FBS), sammen med det bedste sæt af
   sammenligninger, vil også vise sammenligninger som er meget lig en
   sammenligning i det bedste sæt
 * Endelig kan yaha vise alle sammenligninger fundet for hver
   forespørgsel
-OQC- og -FBS-tilstande er specifikt finjusteret til at forme split- læsningsoversættelser, som kan bruges til præcist at identificere strukturelle variationshændelser (sletninger, duplikeringer, indsættelser eller inversioner) mellem emneforespørgslen og referencegenomet.

Other Packages Related to yaha

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download yaha

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
ia64 (unofficial port) 58.0 kB196.0 kB [list of files]