Package: nanopolish (0.14.0-1 and others) [debports]

[ Source:  ]

Konsensuskalder for nanopore-sekvensdata

Nanoplish bruger en skjult Markovmodel på signalniveau til konsensuskald af nanospores genomsekvensdata. Programmet kan udføre analyse på signalniveau for Oxford Nanopore-sekvensdata. Nanopolish kan beregne en forbedret konsensussekvens for en kladdegenomsamling, registrere baseændringer, kalde SNP'er og indels med respekt for et referencegenom med mere.

Other Packages Related to nanopolish

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libhdf5-103-1t64

  HDF5 C-kørselstidsfiler - seriel version

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)

  library for reading & writing SLOW5 files

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)

  Hurtig heltalskompression i C via StreamVByte-kodningen

• dep: libunwind8

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• rec: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• rec: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• sug: make

  Redskab til at dirigere kompileringen

• sug: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

Download nanopolish

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	0.14.0-1+b1	2,281.9 kB	10,820.0 kB	[list of files]