Package: r-bioc-phyloseq (1.46.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-phyloseq  ]

GNU R-håndtering og analyse af høj-gennemløb microbiome censusdata

Bioconductor-modulet phyloseq tilbyder et sæt af klasser og værktøjer til at facilitere import, lager, analyse og grafisk visning af microbiome censusdata.

Other Packages Related to r-bioc-phyloseq

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.36.2)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.22.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biomformat (>= 1.0.0)

  GNU R-grænsefladepakke for filformatet BIOM

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.40.0)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-multtest (>= 2.28.0)

  Biocunductor resampling-baseret flerhypotesetest

• dep: r-cran-ade4 (>= 1.7-4)

  GNU R-analyse af økologiske data

• dep: r-cran-ape (>= 5.0)

  GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution

• dep: r-cran-cluster (>= 2.0.4)

  GNU R-pakke for klyngeanalyse af Rousseeuw et al

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R-udvidelse af Data.frame

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R foreach looping support

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-igraph (>= 1.0.1)

  GNU R-netværksanalyse og visualisering

• dep: r-cran-plyr (>= 1.8.3)

  tools for splitting, applying and combining data

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  Fleksibelt omdanne data - en genstart af pakken reshape

• dep: r-cran-scales (>= 0.4.0)

  Skaler funktioner for visualisering

• dep: r-cran-vegan (>= 2.5)

  Fællesskabsøkologi for R

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.4)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.16.1)

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• sug: r-bioc-genefilter (>= 1.58)

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• sug: r-bioc-metagenomeseq (>= 1.14)

  GNU R-statistisk analyse for tynd høj-gennemløb sekventering

• sug: r-cran-knitr (>= 1.16)

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-magrittr (>= 1.5)

  GNU R forward-pipe operator

• sug: r-cran-rmarkdown (>= 1.6)

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat (>= 1.0.2)

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-phyloseq

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	2,190.2 kB	3,124.0 kB	[list of files]