Package: python3-shasta-doc (0.11.1-4)

[ Source: shasta  ]

Nanopore-helgenomsamling - dokumentation

De novo-samling fra Oxford Nanopore-læsninger. Formålet med Shasta lang læsnings-samleren er hurtigt at fremstille en præcis samlet sekvens via DNA-læsninger som inddata oprettet af Oxford Nanopore-forløbsceller.

Beregningsmetoder brugt af Shasta-samlerne inkluderer:

 * Brug af en afviklingslængde repræsentation for læsesekvensen. Dette
   gør samlingsprocessen meget modstandsdygtig for fejl i homopolymer
   gentagsantal, der er den hyppigste fejltype i Oxford Nanopore-læsninger.

 * Brug i nogle faser af beregningen en repræsentation af læsningssekvensen
   baseret på markører, et fast undersæt af korte k-mer'er (k ≈ 10).

Shastas samlingskvalitet kan sammenlignes med eller er bedre end samlingskvaliteten opnået af andre lang læsnings-samlere.

Denne pakke indeholder dokumentationen for pakkerne shasta og python3-shasta.

Other Packages Related to python3-shasta-doc

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 7.2.2)

  JavaScript-understøttelse for Sphinx-dokumentation

• rec: python3-shasta

  Nanopore-helgenomsamling - dynamisk bibliotek

• rec: shasta

  Nanopore-helgenomsamling - binære filer og skripter

Download python3-shasta-doc

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	24.1 kB	287.0 kB	[list of files]