all options
buster  ] [  sid  ]
[ Source: seqtools  ]

Package: blixem (4.44.1+dfsg-3)

Links for blixem

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package seqtools:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Interaktiv browser for sekvenssammenligninger

Blixem er en interaktiv browser for sekvenssammenligninger, som er blevet stablet op i en »master-slave« multiple-sammenligning; det er ikke en »sand« multiple-sammenligning men en »en til mange«-sammenligning.

 * Overblikssektion der viser positionerne for gener og sammenligninger
   omkring sammenligningsvinduet
 * Detaljesektion der viser den faktiske sammenligning af proteinsekvenser
   eller nukleotid sekvenser til den genomiske DNA-sekvens
 * Vis sammenligninger mod begge tråde af referencesekvensen
 * Vis sekvenser i nukleotid eller proteintilstand; i proteintilstand vil
   Blixem vise tre-ramme oversættelsen af referencesekvensen
 * Rester fremhæves i forskellige farver afhængig af om de er præcise
   match, bevaret erstatning eller uden match
 * Hullede sammenligninger er understøttet, med indsættelser og sletning
   før fremhævelse i matchsekvensen
 * Matchninger kan sorteres og filtreres
 * SNP'er og andre variationer kan fremhæves i referencesekvensen
 * Poly(A)-haler kan vises og poly(A)-signaler fremhævet i
   referencesekvensen

Tags: Interface Toolkit: GTK

Other Packages Related to blixem

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download blixem

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha (unofficial port) 340.9 kB1,415.0 kB [list of files]
amd64 342.2 kB1,147.0 kB [list of files]
arm64 314.0 kB1,115.0 kB [list of files]
armel 286.6 kB943.0 kB [list of files]
armhf 292.9 kB739.0 kB [list of files]
hppa (unofficial port) 333.5 kB1,149.0 kB [list of files]
i386 362.8 kB1,285.0 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 344.0 kB1,207.0 kB [list of files]
mips 339.6 kB1,464.0 kB [list of files]
mips64el 347.5 kB1,542.0 kB [list of files]
mipsel 347.3 kB1,464.0 kB [list of files]
powerpcspe (unofficial port) 320.8 kB1,281.0 kB [list of files]
ppc64 (unofficial port) 346.0 kB1,667.0 kB [list of files]
ppc64el 348.6 kB1,539.0 kB [list of files]
riscv64 (unofficial port) 326.4 kB951.0 kB [list of files]
s390x 311.8 kB1,211.0 kB [list of files]
sh4 (unofficial port) 361.5 kB1,129.0 kB [list of files]
sparc64 (unofficial port) 294.9 kB1,107.0 kB [list of files]
x32 (unofficial port) 342.6 kB1,105.0 kB [list of files]