Package: bitseq (0.7.5+dfsg-6 and others)

[ Source: bitseq  ]

Bayesiansk udledning af transkripter fra sekvensdata

BitSeq er et program til at udlede udtryksniveauer på individuelle transkripter fra sekvensdata (RNA-Seq) og estimering af differentiel udtryk (DE) mellem betingelser. En fordel ved denne fremgangsmåde er muligheden for at tage højde for både teknisk usikkerhed og iboende biologisk varians for at undgå falske DE-kald. Det tekniske bidrag til usikkerheden kommer både fra den finitte læse-dybde og den mulige tvetydige kortlægning af læsninger til flere transkripter.

Other Packages Related to bitseq

• dep: libc6 (>= 2.29) [not alpha, riscv64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [riscv64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 11.2.0-3) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [not alpha, riscv64]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download bitseq

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	363.8 kB	2,250.0 kB	[list of files]
amd64	0.7.5+dfsg-6	337.2 kB	1,927.0 kB	[list of files]
arm64	0.7.5+dfsg-6	298.0 kB	1,691.0 kB	[list of files]
armel	0.7.5+dfsg-6	282.4 kB	1,606.0 kB	[list of files]
armhf	0.7.5+dfsg-6	286.8 kB	1,158.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	311.3 kB	1,720.0 kB	[list of files]
i386	0.7.5+dfsg-6	362.5 kB	2,022.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	317.5 kB	1,730.0 kB	[list of files]
mips64el	0.7.5+dfsg-6	320.9 kB	2,167.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	344.7 kB	2,855.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.7.5+dfsg-6	343.5 kB	2,471.0 kB	[list of files]
riscv64	0.7.5+dfsg-6+b2	335.9 kB	1,440.0 kB	[list of files]
s390x	0.7.5+dfsg-6	297.6 kB	1,955.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	360.8 kB	1,651.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	289.1 kB	1,793.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	338.6 kB	1,766.0 kB	[list of files]