all options
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Source: trinityrnaseq  ]

Package: trinityrnaseq (2.6.6+dfsg-6)

Links for trinityrnaseq

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package trinityrnaseq:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

RNA-Seq De novo Assembly

Trinity repræsenterer en hidtil ukendt fremgangsmåde til effektiv og robust de novo-rekonstruktion af transkriptomer fra RNA-seq-data. Trinity kombinerer tre uafhængige programmoduler: Inchworm, Chrysalis, og Butterfly, anvendt sekventielt til at behandle store mængder af RNA-seq-læsninger. Trinity partitionerer sekvensdata i mange individuelle de Bruijn-grafer, der hver repræsenterer transkriptionel kompleksitet ved et givet gen eller locus, og derefter behandler hver graf uafhængigt for at udvinde fuld længde-isoformer ved splejsning og drille aparte transkripter afledt af paraloge gener.

Other Packages Related to trinityrnaseq

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download trinityrnaseq

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 1,794.9 kB8,883.0 kB [list of files]