Package: snap-aligner (1.0~beta.18+dfsg-3)

[ Source: snap-aligner  ]

Scalable Nucleotide Alignment Program

SNAP er en ny sekvenssammenligner, som er 3-20 gange hurtigere og lige så præcis som eksisterende værktøjer såsom BWA-mem, Bowtie2 og Novoalign. Programmer kan afvikles på gængse x86-processorer og understøtter en rig fejlmodel, som gør at den billigt kan matche læsninger med flere forskelle fra referencen end andre værktøjer. Dette giver SNAP op til 2 gange lavere fejlrate end eksisterende værktøjer (i nogle tilfælde) og lader dig matche større mutationer, som de måske mangler. SNAP læser også BAM, FASTQ eller gzippet FASTQ og skriver SAM eller BAM, med indbygget sortering, dublet markering og BAM-indeks.

Other Packages Related to snap-aligner

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download snap-aligner

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,609.9 kB	13,486.0 kB	[list of files]
arm64	1,602.0 kB	13,434.0 kB	[list of files]