Package: rna-star (2.7.0a+dfsg-1)
Links for rna-star
Debian Resources:
Download Source Package rna-star:
- [rna-star_2.7.0a+dfsg-1.dsc]
- [rna-star_2.7.0a+dfsg.orig.tar.xz]
- [rna-star_2.7.0a+dfsg-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Sascha Steinbiss (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Ultrahurtig univerel RNA-seq-sammenligningsprogram
Programmet Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR) baseret på en tidligere ubeskrevet RNA-seq-sammenligningsalgoritme, som bruger sekventiel maksimal kortlægningsparat seed-søgning i suffikstabeller uden komprimering efterfulgt af seed-klyngeopbygning og syning. STAR er bedre end andre sammenligningsprogrammer med en faktor >50 i kortlægningshastighed, sammenligning med menneskets genom 550 million 2 × 76 bp parret-slut læsninger per time på en moderat server med 12-kerner, mens der på samme tid er en forbedring af sammenligningssensitivitet og præcision. Udover fordomsfri de novo-registrering af kanoniske bindinger kan STAR registrere ikkekanoniske dele og chimeric (fusion) transkriptioner, og kan også oversætte RNA-sekvenser i fuld længde. Via Rocke 454-sekvensering af »reverse transcription polymerase chain reaction amplicons« validerede forfatterne eksperimentelt 1960 novel mellemgenom delbindinger med 80-90 % succes, underbyggende den høje præcision i START-kortlægningsstrategien.
Other Packages Related to rna-star
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libhts2 (>= 1.0)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
Download rna-star
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 437.0 kB | 1,012.0 kB | [list of files] |
arm64 | 410.1 kB | 908.0 kB | [list of files] |