Package: proteinortho (5.16.b+dfsg-1)

[ Source: proteinortho  ]

Registrering af (Co-)ortologer i storskala proteinanalyse

Proteinortho er et uafhængigt værktøj, der er rettet mod store datasæt og gør brug af distribuerede beregningsteknikker, når afviklet på udstyr med flere kerner. Programmet implementerer en udvidet version af den reciprokke bedste sammenligningsheuristik. Proteinortho blev brugt til at beregne orthologous-proteiner i det fulde sæt med alle 717 eubakterielle genomer tilgængelige hos NCBI i begyndelsen af 2009. Forfattere lykkedes med at identificere 30 proteiner til stede i 99 % af alle bakterieproteomer.

Other Packages Related to proteinortho

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [not armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

Download proteinortho

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	139.9 kB	292.0 kB	[list of files]
arm64	137.0 kB	276.0 kB	[list of files]
armhf	134.9 kB	255.0 kB	[list of files]
i386	141.2 kB	287.0 kB	[list of files]