Package: ltrsift (1.0.2-8)

[ Source: ltrsift  ]

Efterbehandling og klassifikation af LTR-retrotransposons

LTRsift er et grafisk skrivebordsværktøj for semiautomatisk efterbehandling af de novo-forudsagte LTR-retrotransposon annotationer, såsom dem oprettet af LTRharvest og LTRdigest. Dets brugervenlige grænseflade viser LTR-retrotransposon kandidater, deres putative familier og deres interne struktur på en hierarkisk måde, der giver brugeren mulighed for at »sift« igennem de undertiden omfangsrige resultater i de novo-forudsigelsesprogrammer. Værktøjet tilbyder også tilpasset filtrering og klassifikationsfunktionalitet.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

Other Packages Related to ltrsift

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  Værktøjssættet til ATK-tilgængelighed

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [not arm64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D - vektorgrafikbibliotek

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  bibliotek til konfiguration af generiske skrifttyper - kørselstid

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  FreeType 2-skriftmotor - delte biblioteksfiler

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  GDK Pixbuf-bibliotek

• dep: libgenometools0

  Alsidigt genomanalysebibliotek

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  GLib-bibliotek for C-rutiner

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  Grafisk brugergrænsefladebibliotek til GTK+

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout og optegning af internationaliseret tekst

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout og optegning af internationaliseret tekst

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout og optegning af internationaliseret tekst

• rec: last-align

  sammenligning af biologisk sekvenser på genom-skala

• rec: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

Download ltrsift

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	106.7 kB	376.0 kB	[list of files]
arm64	90.1 kB	340.0 kB	[list of files]
armhf	94.5 kB	275.0 kB	[list of files]
i386	119.1 kB	447.0 kB	[list of files]