Package: gromacs-mpich (2019.1-1)

[ Source: gromacs  ]

Molekylær dynamisk simulator - binære filer for MPICH-parallelisering

GROMACS er en alsidig pakke til at udføre molekyldynamik med, dvs. simulere Newtons bevægelsesligninger for systemer med hundrede til millioner partikler.

GROMACS er primært designet til biokemiske molekyler såsom proteiner og lipider, som har en masse komplicerede bindingsvekselvirkninger, men da GROMACS er ekstremt hurtig til at beregne ikke-bindingsvekselvirkninger (som plejer at dominere simuleringer), anvender mange grupper det også til forskning inden for ikke-biologiske systemer, f.eks. polymerer.

Denne pakke indeholder kun den grundlæggende simuleringsmotor med parallel understøttelse, der bruger MPICH (v3)-grænsefladen. Den er egnet for knuder for en behandlingsklynge, eller for maskiner med flere processorer.

Tags: Software Development: C Development, Libraries, Field: Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Scope: Utility, Works with: Packaged Software

Other Packages Related to gromacs-mpich

• dep: libc6 (>= 2.27) [amd64, arm64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  Bibliotek for beregning af Fast Fourier Transforms - dobbelt præcision

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  Bibliotek for beregning af Fast Fourier Transforms - Enkel præcision

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libhwloc5 (>= 1.11.12)

  Hierarkisk visning af maskinen - delte biblioteker

• dep: libmpich12

  Shared libraries for MPICH

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [amd64, i386]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 6) [arm64, armhf]

• dep: mpich

  Implementeringen af MPI Message Passing Interface-standarden

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• rec: gromacs

  Simulator af molekyldynamik med bygge- og analyseværktøjer

• sug: gromacs-data

  GROMACS simulator for molekyldynamik - data og dokumentation

Download gromacs-mpich

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	8,050.5 kB	23,268.0 kB	[list of files]
arm64	5,668.8 kB	14,926.0 kB	[list of files]
armhf	3,506.3 kB	8,934.0 kB	[list of files]
i386	6,788.0 kB	22,186.0 kB	[list of files]