Package: beagle (5.0-180928+dfsg-1+deb10u1)

[ Source: beagle  ]

Genotypekald, genotypefase og imputering af ikke genotype-markører

Beagle udfører genotypekald, genotypefase, imputering af ikke genotype-markører og identitet-ved-arv segmentdetektering. Genotypisk imputering fungerer på fasede haplotyper via en Li og Stephens-haplotypefrekvensmodel. Beagle implementerer også Refined IBD-algoritmen for detektering af segmenterne homozygosity-by-descent (HBD) og identity-by-descent (IBD).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::java, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to beagle

• dep: default-jre

  Standardjava eller Javakompatibel kørselstid

  or java11-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-11-jre

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for høj-gennemløbs sekventeringsdata (HTS) - formater

• sug: beagle-doc

  Dokumentation for Beagle

Download beagle

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	273.8 kB	573.0 kB	[list of files]