all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: roary  ]

Package: roary (3.12.0+dfsg-2)

Links for roary

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package roary:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Højhastigheds og uafhængig pan-genomdatakanal

Roary er en højhastigheds og uafhængig pan-genomdatakanal, der bruger kommenterede samlinger i GFF3-format (som fremstillet, for eksempel af Prokka) og som beregner pan-genomet. Ved hjælp af en stationær pc, kan programmet analysere datasæt med tusindvis af prøver, hvilket er beregningsmæssigt umuligt med eksisterende metoder, uden at forringe kvaliteten af resultaterne. 128 prøver kan analyseres på under 1 time ved anvendelse af 1 GB RAM og en enkelt processor. For at udføre denne analyse med brug af eksisterende metoder tager det uger og hundredvis af GB RAM. Rorri er ikke beregnet til meta-genomforskning eller til at sammenligne ekstremt forskelligartede sæt af genomer.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::perl, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing

Other Packages Related to roary

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download roary

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 171.7 kB659.0 kB [list of files]