Package: libhts2 (1.9-12~deb10u1)

[ Source: htslib  ]

C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

HTSlib er en implementering af et ensartet C-bibliotek for adgang til fælles filformater, såsom SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM og VCF (Variant Call Format), brugt for sekvensdata med høj gennemløb, og er basisbiblioteket brugt af samtools og bcftools. HTSlib afhænger kun af zlib. Det vides at være kompatibelt med gcc, g++ og clang.

HTSlib implementerer et generaliseret BAM-indeks (binær SAM), med filudvidelsen »csi« (coordinate-sorted index). HTSlib-fillæseren kigger først efter nye indeks og så efter gamle hvis et nyt indeks mangler.

Tags: Role: Shared Library

Other Packages Related to libhts2

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.23)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  Simpelt adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden - GnuTLS-variant

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  Hurtig, fuld buffer DEFLATE-baseret kompression og dekompression

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download libhts2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	298.2 kB	744.0 kB	[list of files]
arm64	270.9 kB	688.0 kB	[list of files]
armhf	255.0 kB	468.0 kB	[list of files]
i386	324.0 kB	816.0 kB	[list of files]