all options
stretch-backports  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Source: libedlib  ]

Package: edlib-aligner (1.2.4-1)

Links for edlib-aligner

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package libedlib:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Edlib-sekvenssammenligningsværktøj der bruger edit distance

Edlib er et simpelt og super hurtigt C/C++-bibliotek til sekvenssammenligning via edit distance. Denne pakke tilbyder en sammenligner, der bruger dette bibliotek.

Funktioner i libedlib:

 * Beregner edit distance (Levehnstein distance)
 * Kan finde optimale sammenligningssti (instruktioner om transformering
   af den første sekvens til den anden sekvens)
 * Understøtter flere sammenligningsmetoder: global(NW), prefix(SHW) og
   infix(HW), hver af dem nyttige i forskellige scenarier
 * Du kan udvide tegnlighedsdefinitionen, så du f.eks. kan have jokertegn,
   for sammenligning uden hensyn til store/små bogstaver eller til at
   arbejde med degenererede nukleotider
 * Kan nemt håndtere små eller meget store sekvenser, selv når
   sammenligningsstier skal findes, men med meget lille hukommelsesforbrug
 * Super hurtig takket være Myers' bit-vektor algoritme

Other Packages Related to edlib-aligner

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download edlib-aligner

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 22.6 kB65.0 kB [list of files]
arm64 21.4 kB61.0 kB [list of files]
armel 19.6 kB56.0 kB [list of files]
armhf 19.5 kB48.0 kB [list of files]
i386 22.9 kB68.0 kB [list of files]
mips 22.0 kB61.0 kB [list of files]
mips64el 22.1 kB66.0 kB [list of files]
mipsel 22.2 kB61.0 kB [list of files]
ppc64el 25.1 kB85.0 kB [list of files]
s390x 21.8 kB65.0 kB [list of files]