Package: python3-cyvcf2 (0.30.4-4)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF-fortolker baseret på htslib - Python 3

Dette modul tillader hurtig fortolkning af VCF og BCF inklusive regionsforespørgsler med Python. Dette er essentielt for effektiv analyse af nukleotid variation med Python på sekventeringsdata med høj-gennemløb.

Cyvcf2 er et cython-omslag omkring htslib. Attributter som variant.gt_ref_depths returnerer en numpy-tabel direkte, så de er direkte klar til brug.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

Other Packages Related to python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-click

  Omslag omkring optparse for kommandolinjeredskaber - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

Download python3-cyvcf2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	787.7 kB	4,755.0 kB	[list of files]
arm64	758.6 kB	4,694.0 kB	[list of files]
armel	758.7 kB	4,662.0 kB	[list of files]
armhf	759.8 kB	4,482.0 kB	[list of files]
i386	787.5 kB	4,779.0 kB	[list of files]
mips64el	742.9 kB	4,773.0 kB	[list of files]
mipsel	743.9 kB	4,724.0 kB	[list of files]
ppc64el	787.2 kB	4,870.0 kB	[list of files]
s390x	751.4 kB	4,749.0 kB	[list of files]