Package: pbbamtools (1.6.0+dfsg-2)

[ Source: pbbam  ]

Behandling af Pacific Biosciences binære sammenlignings-/oversættelsesfiler

BAM-formatet er et binært, komprimeret, postorienteret containerformat for rå eller sammenlignede sekvenslæsninger. Det associerede SAM-format er en tekstrepræsentation af de samme data. Specifikationerne for BAM/SAM vedligeholdes af SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-fremstillede BAM-filer er fuldt kompatible med BAM-specifikationen, men gør brug af udvidelsesmekanismer for BAM-specifikationen til at kode PacBio-specifik information.

Denne pakke tilbyder redskaber for kommandolinjen til arbejdet med PacBio BAM-filer.

Other Packages Related to pbbamtools

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libpbbam1.6.0 (= 1.6.0+dfsg-2)

  Pacific Biosciences binære sammenlignings-/oversættelsesbibliotek (BAM)

• dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

  Datastrukturer, algoritmer og redskaber for C++-programmer

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• rec: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download pbbamtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	91.3 kB	354.0 kB	[list of files]
arm64	81.3 kB	310.0 kB	[list of files]
mips64el	86.0 kB	369.0 kB	[list of files]
ppc64el	90.3 kB	554.0 kB	[list of files]