Package: ncbi-entrez-direct (14.6.20210224+dfsg-4 and others)

[ Source: ncbi-entrez-direct  ]

NCBI Entrez-redskaber på kommandolinjen

Entrez Direct (EDirect) er en avanceret metode til at tilgå NCBI's sæt af forbundne databaser (udgivelse, sekvens, struktur, gen, variation, udtryk etc.) fra et terminalvindue eller et skript. Funktioner anvender søgetermer fra kommandolinjeargumenter. Individuelle operationer kombineres til at bygge forespørgsler i flere trin. Postindhentelse og formatering fuldender normalt processen.

EDirect tilbyder også en funktion drevet af argumenter, der forenkler udtrækningen af data fra dokumentresume eller andre resultater, der returneres i struktureret XML-format. Dette kan eliminere behovet for at skrive tilpassede programmer for at besvare ad hoc-spørgsmål. Forespørgsler kan flytte problemfrit mellem EDirect-kommandoer og UNIX-redskaber eller skripter for at udføre handlinger, der ikke kan opnås helt i Entrez.

Other Packages Related to ncbi-entrez-direct

• dep: curl

  Kommandolinjeværktøj for overførsel af data med adressesyntaks

  or wget

  Henter filer fra nettet

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3.2) [amd64, mips64el]

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, mipsel, s390x]

• dep: libwww-perl

  simpel og konsistent grænseflade til World Wide Web

• dep: libxml-simple-perl

  Perlmodul for læsning og skrivning af XML

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• sug: curl

  Kommandolinjeværktøj for overførsel af data med adressesyntaks

• sug: libxml2-utils

  XML-redskaber

• sug: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

Download ncbi-entrez-direct

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	14.6.20210224+dfsg-4+b1	2,034.1 kB	10,263.0 kB	[list of files]
arm64	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,813.4 kB	9,847.0 kB	[list of files]
armel	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,810.3 kB	9,119.0 kB	[list of files]
armhf	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,801.7 kB	8,991.0 kB	[list of files]
i386	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,938.8 kB	8,920.0 kB	[list of files]
mips64el	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,735.4 kB	10,887.0 kB	[list of files]
mipsel	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,725.9 kB	10,024.0 kB	[list of files]
ppc64el	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,786.1 kB	9,848.0 kB	[list of files]
s390x	14.6.20210224+dfsg-4+b1	1,860.7 kB	10,295.0 kB	[list of files]