all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: hts-nim-tools  ]

Package: hts-nim-tools (0.2.1-1)

Links for hts-nim-tools

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package hts-nim-tools:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Værktøjer til biologiske sekvenser: bam-filter, count-reads, vcf-check

Denne pakke tilbyder flere værktøjer, der (i det mindste på tidspunktet for deres oprettelse) tilbyder funktionaliteter udover rutinen tilbudt af samtools og andre omvendte afhængigheder af htslib.

Disse nye værktøjer er

 * bam-filter : filtrer BAM/CRAM/SAM-filer med et simpelt udtrykssprog
 * count-reads: tæl BAM/CRAM-læsninger i regioner givet en BED-fil
 * vcf-check  : tjek regioner for en VCF mod en baggrund for manglende dele

Og ja, som navnet foreslår, er disse værktøjer alle implementeret i nim, via omslaget nim-hts (opstrøm: hts-nim) for htslib.

Other Packages Related to hts-nim-tools

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download hts-nim-tools

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 198.0 kB864.0 kB [list of files]
arm64 164.6 kB844.0 kB [list of files]
armel 182.9 kB832.0 kB [list of files]
armhf 182.9 kB604.0 kB [list of files]
i386 186.0 kB843.0 kB [list of files]
mips64el 137.8 kB951.0 kB [list of files]
mipsel 141.6 kB934.0 kB [list of files]
ppc64el 158.6 kB916.0 kB [list of files]