Package: gsort (0.1.4-3 and others)

[ Source: gsort  ]

Sorter genomiske data

Gsort er et værktøj til at sortere genomiske filer jævnfør en genomfil. For eksempel, for at sortere VCF til rækkefølgeordning: X, Y, 2, 1, 3, ... og teksthovedet skal være øverst.

Et mere sandsynligt eksempel, hvis en fil skal sorteres for at matche GATK-rækkefølgen (1 ... X, Y, MT), hvilket ikke er muligt med noget sorteringsværktøj. Med gsort kan man bare placere MT som det sidste kromosom i ».genome«-filen.

Vil også være nyttig for at hente filer klar til brug i bedtools.

Other Packages Related to gsort

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not arm64, i386, ppc64el]

Download gsort

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.1.4-3+b6	1,705.1 kB	5,379.0 kB	[list of files]
arm64	0.1.4-3+b6	1,454.0 kB	4,966.0 kB	[list of files]
armel	0.1.4-3+b6	1,485.7 kB	4,613.0 kB	[list of files]
armhf	0.1.4-3+b6	1,480.4 kB	4,613.0 kB	[list of files]
i386	0.1.4-3+b6	1,620.6 kB	4,579.0 kB	[list of files]
mips64el	0.1.4-3+b6	1,375.7 kB	5,457.0 kB	[list of files]
mipsel	0.1.4-3+b6	1,400.7 kB	5,105.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.1.4-3+b6	1,429.0 kB	5,030.0 kB	[list of files]
s390x	0.1.4-3+b6	1,559.0 kB	5,289.0 kB	[list of files]