Package: kalign (1:3.3-1 and others)

[ Source: kalign  ]

Global og progressiv flersekvensjustering

Kalign er et kommandolinjeværktøj til at udføre flerjustering af biologiske sekvenser. Den bruger Muth-Manbers algoritme til strengmatchning, både til at forbedre præcisionen og hastigheden for justeringen. Den bruger global, progressiv justeringsfremgangsmåde, forbedret ved at bruge en omtrentlig strengmatchende algoritme til at beregne sekvensafstande og ved at indarbejde lokale matchninger i den ellers globale justering.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to kalign

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• enh: bioperl-run

  BioPerl-omslag: skripter

• enh: t-coffee

  Flersekvensjustering

Download kalign

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	1:3.3-1+b3	85.0 kB	341.0 kB	[list of files]