Package: libbio-featureio-perl (1.6.905-2)

[ Source: libbio-featureio-perl  ]

Moduler til at læse, skrive og manipulere sekvensfunktioner

Et I/O-iterator undersystem for funktioner til genomsekvenser.

Bio::FeatureIO er et håndteringsmodul for formaterne i FeatureID-sættet (f.eks. Bio::FeatureIO::GFF). Det er en officielt sanktioneret måde at hente formatobjekterne, som de fleste folk bør bruge.

Bio::FeatureIO-systemet kan ses som en biologisk filhåndtering. De er vedhæftet filhåndteringer med smarte formateringsregler (f.eks. GFF-format, eller BED-format) og kan enten læse eller skrive funktionsobjekter (Bio::SeqFeature-objekter, eller mere præcist, Bio::FatureHolderI implementerer objekter, hvor Bio::SeqFeature er et sådant objekt). Hvis du ønsker at vide, hvad der skal ske med et Bio::SeqFeature1-objekt, så læs Bio::SeqFeatureI.

Ideen er at du anmoder om et strømobjekt for et bestemt format. Alle strømobjekterne har et begreb for en intern fil, der læses fra eller skrives til. En bestemt FeatureIO-objektinstans konfigureres for enten inddata eller uddata. Et specifikt eksempel for et strømobjekt er Bio::FeatureIO::gff-objektet.

Other Packages Related to libbio-featureio-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - grundlæggende Perlmoduler

• dep: libscalar-list-utils-perl

  Moduler der tilbyder gængse scalar- og list utility-underrutiner

• dep: libtree-dagnode-perl

  Perl (super)class for representing nodes in a tree

• dep: liburi-perl

  modul til at manipulere og tilgå URI-strenge

• dep: libxml-dom-perl

  Perlmodul for bygning af doc-strukturer der overholder DOM niveau 1

• dep: libxml-dom-xpath-perl

  adds XPath support to XML::DOM, using XML::XPathEngine

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

Download libbio-featureio-perl

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	52.0 kB	146.0 kB	[list of files]