Package: libfreecontact-doc (1.0.21-9)
Links for libfreecontact-doc
Debian Resources:
Download Source Package freecontact:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
Dokumentation for libfreecontact
FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).
FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.
En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.
Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.
Denne pakke indeholder HTML-dokumentation for libfreecontact.
Other Packages Related to libfreecontact-doc
|
|
|
|
-
- dep: libjs-jquery
- JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer
Download libfreecontact-doc
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 99.4 kB | 1,268.0 kB | [list of files] |