Package: biobambam2 (2.0.179+ds-1)

[ Source: biobambam2  ]

Værktøjer for tidlig trin behandling af sammenligningsfil

Denne pakke indeholder nogle værktøjer til at behandle BAM-filer, inklusive

 bamsormadup:   parallel sortering og dubletmarkering
 bamcollate2:   læser BAM og skriver BAM i ny rækkefølge så at
                sammenligningen eller sorteringen er efter
                forespørgselsnavn
 bammarkduplicates: læser BAM og skriver BAM med dubletsammenligninger
                    markeret via BAM-flagfelterne
 bammaskflags:  læser BAM og skriver BAM mens der skjules (fjernes)
                bit fra flagkolonnen
 bamrecompress: læser BAM og skriver BAM med en defineret
                komprimeringsindstilling. Dette værktøj kan bruge
                flere tråde.
 bamsort:       læser BAM og skriver BAM i ny rækkefølge efter
                koordinater eller forespørgelsesnavn
 bamtofastq:    læser BAM og skriver FastQ; resultatet kan være
                sorteres eller uden sortering efter forespørgelsesnavn

Other Packages Related to biobambam2

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libmaus2-2 (>= 2.0.768+dfsg)

  Samling af datastrukturer og algoritmer for biobambam

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download biobambam2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	9,201.5 kB	65,075.0 kB	[list of files]
arm64	8,442.3 kB	61,559.0 kB	[list of files]
i386	9,888.3 kB	73,243.0 kB	[list of files]
ppc64el	9,076.5 kB	79,263.0 kB	[list of files]