all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: tophat-recondition  ]

Package: tophat-recondition (1.4-3)

Links for tophat-recondition

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package tophat-recondition:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Efterbrænder for TopHat-uoversatte læsninger

Tophat-recondition er en efterbrænder for TopHat-uoversatte læsninger (indeholdt i unmapped.bam), der gør dem kompatible med nedstrømsværktøjer (f.eks. Picard-programpakken, samtools, GATK) (TopHat problem #17). Omfatter også løsninger på fejl i TopHat:

 * SAM-flaget »mate is unmapped« angives ikke på enhver læsning i filen
   unmapped.bam (TopHat problem #3)
 * Den oversatte mate for en læsning (der ikke er oversat) kan mangle fra
   accepted_hits.bam, hvilket skaber en forskel mellem filen og de
   ikke oversatte læsningers flag (TopHat problem #16)

Other Packages Related to tophat-recondition

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download tophat-recondition

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 10.9 kB36.0 kB [list of files]