Package: skewer (0.2.2-2)

[ Source: skewer  ]

Efterbehandling af høj-gennemløb DNA-sekvenslæsninger

Skewer implementerer den bit-maskede k-forskels matchende algoritme dedikeret til opgaven med adapter-tilpasning og den er specielt designet til at behandle næstegenerations sekventering (NGS) paired-end sekvenser.

Funktioner

 * Registrering og fjernelse af adaptersekvenser
 * Indsættelse og sletning tilladt i mønstermatchning
 * Målrettet læsningerne Single End, Paired End (PE) og Long Mate
   Pair (LMP)
 * Demultiplexing af stregkodede sekventeringsafviklinger
 * Tilpasning baseret på phred-kvalitetsbedømmelser
 * IUPAC-tegn for stregkoder og adaptere
 * Komprimeret understøttelse for inddata og uddata

Other Packages Related to skewer

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download skewer

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armhf	60.4 kB	130.0 kB	[list of files]