Package: bitseq (0.7.5+dfsg-5)

[ Source: bitseq  ]

Bayesiansk udledning af transkripter fra sekvensdata

BitSeq er et program til at udlede udtryksniveauer på individuelle transkripter fra sekvensdata (RNA-Seq) og estimering af differentiel udtryk (DE) mellem betingelser. En fordel ved denne fremgangsmåde er muligheden for at tage højde for både teknisk usikkerhed og iboende biologisk varians for at undgå falske DE-kald. Det tekniske bidrag til usikkerheden kommer både fra den finitte læse-dybde og den mulige tvetydige kortlægning af læsninger til flere transkripter.

Other Packages Related to bitseq

• dep: libc6 (>= 2.23)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

  Package not available

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download bitseq

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armhf	288.6 kB	1,106.0 kB	[list of files]