Package: anfo (0.98-8)

[ Source: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper fra MPG

Anfo er en mapper i stil med Soap/Maq/Bowtie, men dets implementering har arvet mere fra BLAST/BLAT. Det er mest nyttig for sammenligning af sekvenslæsninger hvor DNA-sekvensen er ændret en smule (tænk ældre DNA eller bisulfit behandling) og/eller der er større forskel mellem prøve og reference end hvad hurtige mappere vil håndtere pænt (lad os sige at referencearvemassen mangler og en tæt forbundet art bruges i stedet for).

Other Packages Related to anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Bibliotek for Short Read Aligner/Mapper fra MPG

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libelk0

  Implementering af Scheme - Extension Language Kit

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  Bibliotek til at tolke kommandolinjeparametre

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)

  Protokolbuffere - C++-bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download anfo

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	113.9 kB	439.0 kB	[list of files]
arm64	105.2 kB	395.0 kB	[list of files]
armel	99.8 kB	345.0 kB	[list of files]
armhf	102.0 kB	305.0 kB	[list of files]
i386	119.6 kB	417.0 kB	[list of files]
mips64el	109.5 kB	438.0 kB	[list of files]
mipsel	110.5 kB	411.0 kB	[list of files]
ppc64el	114.8 kB	619.0 kB	[list of files]
s390x	104.0 kB	411.0 kB	[list of files]