Package: spaln (2.4.13f+dfsg-1)

[ Source: spaln  ]

Opdelingsparat transkript-sammenligning til genomisk DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) er et uafhængigt program, der kortlægger og sammenligner et sæt af cDNA- eller proteinsekvenser til en hel genomisk sekvens i et enkelt job. Udfører også opdelt eller ordinær sammenligning efter hurtig lighedssøgning mod en proteinsekvensdatabase, hvis et genomisk segment eller en amino-syresekvens er angivet i en forespørgsel.

Spaln understøtter en kombination af proteinsekvensdatabase og et angivet genomisk segment og udfører hurtige lighedssøgninger og (semi-)global sammenligning af et sæt af proteinsekvensforespørgsler mod en proteinsekvensdatabase. Spaln adopterer flerfase heuristik, der gør det muligt at udføre jobbet på en konventionel personlig computer.

Other Packages Related to spaln

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: spaln-data

  Opdelingsparat transkript-sammenligning til genomisk DNA - data

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download spaln

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	338.7 kB	821.0 kB	[list of files]
arm64	304.6 kB	835.0 kB	[list of files]
mips64el	323.1 kB	1,047.0 kB	[list of files]
ppc64el	353.4 kB	1,092.0 kB	[list of files]
s390x	341.4 kB	954.0 kB	[list of files]