Package: snpomatic (1.0-6)

[ Source: snpomatic  ]

Hurtig, stringent kort-læsning oversættelsesprogram

Sekvensteknologier med høj gennemløb opretter store mængder af korte læsninger. Oversættelse af disse til en referencesekvens forbruger store mængder af behandlingstid og hukommelse, og læste oversættelsesfejl kan føre til støj eller ukorrekte sammenligninger.

SNP-o-matic er et hurtigt, stringent kort-læsning oversættelsesprogram. Det understøtter en mængde af uddatatyper og formater, for brug i filtrering, sammenligninger, sekvensbaseret genotypekald, assisteret nysamling af contigs etc.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download snpomatic

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	83.1 kB	216.0 kB	[list of files]
arm64	74.2 kB	216.0 kB	[list of files]
armel	67.5 kB	175.0 kB	[list of files]
armhf	69.4 kB	135.0 kB	[list of files]
i386	85.7 kB	219.0 kB	[list of files]
mips64el	77.2 kB	286.0 kB	[list of files]
mipsel	77.6 kB	284.0 kB	[list of files]
ppc64el	86.0 kB	280.0 kB	[list of files]
s390x	73.6 kB	212.0 kB	[list of files]