[ Source: yanagiba ]
Package: yanagiba (1.0.0-5)
Links for yanagiba
Debian Resources:
Download Source Package yanagiba:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Filtrer Oxford Nanopore-læsninger i lav kvalitet basecalled med Albacore
Yanagiba bruges til at filtrere Oxford Nanopore-læsninger i kort eller lav kvalitet, der er blevet basecalled med Albacore. Programmet bruger fastq.gz og en Albacore-resumefil. Hvis ingen Albacore-resumefil er angivet forsøges en direkte beregning på middel qscore fra fastq-filen via NanoMath. Bemærk: Beregnede kvalitetsbedømmelser fremstår lavere for læsninger kaldt med Metrichor, du skal eventuelt mindske din minqual-indstilling i dette tilfælde.
Other Packages Related to yanagiba
|
|
|
|
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- dep: python3-nanomath
- simple math function for other Oxford Nanopore processing scripts
-
- dep: python3-pandas
- Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
Download yanagiba
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 25.0 kB | 57.0 kB | [list of files] |