всички настройки
wheezy  ] [  jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: t-coffee  ]

Пакет: t-coffee (11.00.8cbe486-5)

Връзки за t-coffee

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник t-coffee.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

Multiple Sequence Alignment

T-Coffee is a multiple sequence alignment package. Given a set of sequences (Proteins or DNA), T-Coffee generates a multiple sequence alignment. Version 2.00 and higher can mix sequences and structures.

T-Coffee allows the combination of a collection of multiple/pairwise, global or local alignments into a single model. It can also estimate the level of consistency of each position within the new alignment with the rest of the alignments. See the pre-print for more information

T-Coffee has a special called M-Coffee that makes it possible to combine the output of many multiple sequence alignment packages. In its published version, it uses MUSCLE, PROBCONS, POA, DiAlign-TS, MAFFT, Clustal W, PCMA and T-Coffee. A special version has been made for Debian, DM-Coffee, that uses only free software by replacing Clustal W by Kalign. Using the 8 Methods of M-Coffee can sometimes be a bit heavy. You can use a subset of your favorite methods if you prefer.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Need an extra tag, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Други пакети, свързани с t-coffee

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на t-coffee

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 1 872,9 кБ3 683,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1 752,5 кБ3 559,0 кБ [списък на файловете]
armel 1 713,4 кБ3 506,0 кБ [списък на файловете]
armhf 1 730,3 кБ2 902,0 кБ [списък на файловете]
i386 1 874,0 кБ3 974,0 кБ [списък на файловете]
mips 1 799,8 кБ4 142,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 1 815,9 кБ4 227,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 1 811,7 кБ4 142,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1 843,8 кБ4 139,0 кБ [списък на файловете]
s390x 1 764,5 кБ3 863,0 кБ [списък на файловете]