всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Източник: miniasm  ]

Пакет: miniasm (0.2+dfsg-2 и други)

Връзки за miniasm

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник miniasm.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Етикети: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::program, science::calculation, Purpose: Calculating, use::comparing, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с miniasm

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на miniasm

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 0.2+dfsg-2+b1 28,8 кБ71,0 кБ [списък на файловете]
arm64 0.2+dfsg-2+b1 24,9 кБ63,0 кБ [списък на файловете]
armel 0.2+dfsg-2+b1 28,1 кБ71,0 кБ [списък на файловете]
armhf 0.2+dfsg-2+b1 26,6 кБ55,0 кБ [списък на файловете]
i386 0.2+dfsg-2+b1 30,8 кБ75,0 кБ [списък на файловете]
mips 0.2+dfsg-2+b1 30,1 кБ78,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 0.2+dfsg-2+b1 29,5 кБ79,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 0.2+dfsg-2+b1 30,2 кБ78,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 0.2+dfsg-2+b1 27,8 кБ83,0 кБ [списък на файловете]
s390x 0.2+dfsg-2+b1 28,2 кБ75,0 кБ [списък на файловете]