всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: spaced  ]

Пакет: spaced (1.2.0-201605+dfsg-1)

Връзки за spaced


Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник spaced.


Външни препратки:

Подобни пакети:

alignment-free sequence comparison using spaced words

Spaced (Words) is a new approach to alignment-free sequence comparison. While most alignment-free algorithms compare the word-composition of sequences, spaced uses a pattern of care and don't care positions. The occurrence of a spaced word in a sequence is then defined by the characters at the match positions only, while the characters at the don't care positions are ignored. Instead of comparing the frequencies of contiguous words in the input sequences, this new approach compares the frequencies of the spaced words according to the pre-defined pattern. An information-theoretic distance measure is then used to define pairwise distances on the set of input sequences based on their spaced-word frequencies. Systematic test runs on real and simulated sequence sets have shown that, for phylogeny reconstruction, this multiple-spaced-words approach is far superior to the classical alignment-free approach based on contiguous word frequencies.

Други пакети, свързани с spaced

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на spaced

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 62,4 кБ185,0 кБ [списък на файловете]
amd64 55,7 кБ161,0 кБ [списък на файловете]
arm64 50,1 кБ137,0 кБ [списък на файловете]
armel 47,9 кБ132,0 кБ [списък на файловете]
armhf 48,6 кБ96,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 61,6 кБ158,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 63,3 кБ164,0 кБ [списък на файловете]
i386 63,1 кБ168,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 55,3 кБ153,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 63,0 кБ164,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 52,5 кБ144,0 кБ [списък на файловете]
mips 57,8 кБ178,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 56,9 кБ184,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 58,9 кБ178,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 58,9 кБ208,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 59,2 кБ209,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 59,4 кБ209,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 54,5 кБ117,0 кБ [списък на файловете]
s390x 51,4 кБ161,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 71,4 кБ144,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 49,2 кБ155,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 56,0 кБ148,0 кБ [списък на файловете]