Пакет: skewer (0.2.2-6 и други)

Връзки за skewer

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник skewer.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Други пакети, свързани с skewer

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.17) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на skewer

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.2.2-6	87,6 кБ	227,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.2.2-6+b1	86,4 кБ	216,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.2.2-6+b1	76,4 кБ	235,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.2.2-6+b1	75,2 кБ	235,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.2.2-6+b1	75,5 кБ	171,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.2.2-6	83,6 кБ	195,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.2.2-6+b1	90,2 кБ	231,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.2.2-6	107,3 кБ	387,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.2.2-6	83,4 кБ	209,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.2.2-6+b1	81,5 кБ	242,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.2.2-6	83,7 кБ	235,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.2.2-6+b1	84,9 кБ	236,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.2.2-6+b1	80,3 кБ	159,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.2.2-6+b1	76,0 кБ	199,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.2.2-6	98,1 кБ	190,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.2.2-6	75,2 кБ	197,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.2.2-6	86,1 кБ	201,0 кБ	[списък на файловете]