Пакет: sumaclust (1.0.36+ds-2 и други)

Връзки за sumaclust

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник sumaclust.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [metabarcoding.org]

Подобни пакети:

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Други пакети, свързани с sumaclust

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [не alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust

Изтегляне на sumaclust

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	101,8 кБ	196,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.0.36+ds-2	100,6 кБ	164,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0.36+ds-2	99,6 кБ	195,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0.36+ds-2	101,6 кБ	195,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0.36+ds-2	99,5 кБ	195,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	100,9 кБ	160,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0.36+ds-2	100,9 кБ	163,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	104,5 кБ	181,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	98,8 кБ	163,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0.36+ds-2	100,1 кБ	197,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	101,5 кБ	196,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0.36+ds-2	101,4 кБ	260,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0.36+ds-2+b1	100,4 кБ	156,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0.36+ds-2	99,5 кБ	159,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	100,3 кБ	195,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	99,5 кБ	1 157,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.0.36+ds-2	100,6 кБ	163,0 кБ	[списък на файловете]